Après la transmission, en 2013, des données du Livre rouge de la flore menacée de France et des données relatives aux plantes messicoles, la FCBN a transmis au MNHN un lot de plus de 21 millions de données, issu du réseau des CBN.

Ces données concernent la flore (Trachéophytes et Bryophytes au sens large ou Cryptogames et Phanérogames) et la fonge (champignons dont lichens) du territoire métropolitain (île de la Réunion et métropole, hors Alsace et Lorraine).

L’ensemble de ces données est désormais accessible dans l’INPN en réponse à la mise en œuvre de la convention nationale de partenariat tripartite entre le MEDDE, le MNHN et la FCBN, signée le 12 avril 2012. 

Cette convention vise à mettre en place une organisation contribuant à l'inventaire du patrimoine naturel pour la flore et les habitats.

Les données proviennent des inventaires menés par les Conservatoires botaniques nationaux mais aussi d'un riche tissu d'associations, gestionnaires d'espaces naturels, établissements publics, etc., partenaires des CBN. 

Le recueil, la gestion, la validation scientifique des connaissances nouvelles sont réalisés par le réseau des CBN au titre de leur mission de service public, et la restitution nationale des connaissances par la FCBN et le MNHN. D'autre part, le MNHN a partagé les données flore hébergées dans l'INPN et permis ainsi au réseau des CBN d'améliorer la qualification de la connaissance sur la flore et les habitats en France ainsi que la production des couches de référence sur la répartition des espèces en France.
Cette organisation, fondée sur la définition des rôles de chacun des partenaires et la mutualisation de compétences, est déployée en respectant les principes issus de la convention d’Aarhus, de la directive européenne INSPIRE et du Système d'Information sur la Nature et les Paysages (SINP).

ATTENTION, les données intégrées à l'INPN pour les régions Aquitaine (hors montagnes) et Poitou-Charentes concernent les données de l'Observatoire de la Flore Sud-Atlantique (OFSA) antérieures à 2013 et hors contributions extérieures. Les très nombreuses données collectées ou intégrées à l'OFSA sur le territoire sud-atlantique depuis 2013 (plus de 500 000) n'apparaissent donc pas sur le site de l'INPN et ne sont consultables que sur le site de l'OFSA.

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