Suite à l’intégration de la compétence fonge dans les missions des Conservatoires botaniques nationaux (CBN) en 2019, le CBN Sud-Atlantique a engagé le développement des connaissances sur les champignons en 2023 avec le lancement d'une étude d'ampleur sur les cortèges mycologiques des dunes littorales de Nouvelle-Aquitaine. 

Cette vaste étude réalisée en 2023-2024 visait les objectifs suivants : 

• Réaliser une synthèse bibliographique sur les cortèges mycologiques associés à ces milieux, et valoriser les connaissances préexistantes en les intégrant dans la base de données de l'Observatoire de la biodiversité végétale de Nouvelle-Aquitaine ;
• Mener de nouvelles prospections de terrain afin d'enrichir les connaissances et dresser un inventaire actualisé ;
• Caractériser les communautés d’espèces en fonction notamment de la séquence dunaire et des paramètres environnementaux ; 
• Evaluer et hiérarchiser les enjeux de conservation (bioévaluation) des espèces de la fonge dunaire ;
• Etudier la définition d’indicateurs fongiques d’état de conservation de l’habitat d'intérêt communautaire dunes grises (UE 2130*) en corrélation avec les communautés d'espèces végétales et lichéno-bryophytiques.

Après une présentation générale du littoral et des trois secteurs édaphiques qui le composent, l’étude rappelle quelques notions fondamentales de mycologie, dont certaines sont marquées par les bouleversements de la biologie moléculaire.

L'étude bibliographique présente ensuite la compilation de plus de 10 000 données à l'issue du dépouillement d'une abondante littérature, constituant ainsi une synthèse sans précédent des travaux des mycologues ayant étudié les dunes littorales de Nouvelle-Aquitaine.

En complément, 23 sessions de terrain menées en périodes printanières, automnales et hivernales, ont permis de recenser 235 espèces dont 9 nouvelles espèces pour la région Nouvelle-Aquitaine, mais également 24 nouvelles espèces pour la Gironde et 32 nouvelles espèces pour les Landes (en l'état acuel des données bibliographiques et des connaissances à notre disposition). 

Au total, l'étude porte ainsi à près de 1 400 le nombre d’espèces de champignons présentes sur le littoral dunaire dont environ 280 spécifiques aux dunes non boisées. La pression d’inventaire reste cependant encore très hétérogène sur le littoral, d’où la nécessité d’autres études de terrain afin de combler les nombreuses lacunes qui subsistent, et qui seront certainement sources de nouvelles découvertes.

Malgré ces données disparates, des analyses ont pu être amorcées pour évaluer la patrimonialité des champignons des dunes. Elles montrent une proportion non négligeable d’espèces menacées au regard des critères de l’UICN, sur la base des listes rouges disponibles aux niveaux national et régional. Ces analyses descriptives ont été par la suite complétées par les calculs d’indices patrimoniaux qui démontrent l’importante valeur patrimoniale de la fonge dunaire des trois secteurs édaphiques.

L'étude fonctionnelle a quant à elle permis d'explorer la répartition des espèces selon leur comportement trophique, mettant notamment en évidence une importante proportion des espèces saprotrophes tout au long du transect dunaire, avec notamment des espèces humicoles ou coprophiles pour la dune ouverte, laissant la place à des espèces plus ubiquistes, ectomycorhiziennes et saprotrophes lignicoles vers la dune boisée. L'analyse fonctionnelle a également été réalisée à différentes résolutions par l’utilisation de deux typologies d'habitats afin de comparer les différents faciès dunaires et les secteurs édaphiques entre eux. À cet effet, des indicateurs ont été expérimentés. Un essai sur les communautés fongiques et les parallèles possibles avec les communautés de flore vasculaire et bryo-lichéniques a en outre été proposé. 

Cet état des lieux constitue le point de départ d’une étude diachronique, où la prospection de transects dunaires pendant la période propice, à savoir d’octobre à mars, permettra de combler les lacunes identifiées dans les connaissances taxinomiques, écologiques et patrimoniales.

Notons enfin que les connaissances et l'expertise acquises grâce à cette étude sur la patrimonialité des champignons dunaires ont été remobilisées dans le cadre de l'élaboration des listes d'espèces protégées aux niveaux national et régional, chantiers engagés en 2025 par les Conservatoires botaniques nationaux, afin de permettre la protection et la conservation des espèces à enjeux. 

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